Светлана родилась в Москве, но долгое время жила с мамой в подмосковном городе Железнодорожный. Отца девочка почти не знала — он изъявил желание пообщаться с дочерью, лишь когда ей исполнилось 18 лет. 1990-е годы были тяжелыми для большинства россиян, не стала исключением и семья Ходченковых. Чтобы как-то выжить, мама Светланы, штукатур-маляр по профессии, подрабатывала дворником и уборщицей. С 11 лет девочка помогала матери убирать подъезды, пытаясь заработать лишний рубль.
Многие одноклассники Светланы были из обеспеченных семей, красиво и модно одевались, и в девочке начали зарождаться комплексы и неуверенность в себе. Чтобы преодолеть это, в 16 лет она записалась в школу моделей Вячеслава Зайцева, а окончив ее, была принята в модельное агентство. Первый контракт не заставил себя ждать: девушку пригласили на полгода в Японию. На заработанную тысячу долларов она установила дома стационарный телефон — в подарок маме. Но впоследствии из-за предложений интимного характера, так шокировавших юную девушку, Светлане пришлось оставить модельный бизнес.
Прорвалась актриса и в Голливуд. Вместе с Константином Хабенским, Гэри Олдменом, Колином Фёртом, Бенедиктом Камбербэтчем и др. она снялась в триллере «Шпион, выйди вон!». В 2011 году она представила фильм на Венецианском кинофестивале вместе с зарубежными коллегами. В 2013 году она работала с Хью Джекманом в голливудском блокбастере «Росомаха: Бессмертный», где сыграла главного антагониста — Гадюку.
С 2005 по 2010 год Светлана Ходченкова была замужем за Владимиром Яглычем. Познакомились они в Щукинском училище, а потом пересеклись на съемках двух фильмов, в одном из которых («Карусель») играли супругов. В день премьеры сериала Владимир позвонил Светлане и предложил отпраздновать это событие. Ужин в ресторане стал их первым свиданием. 13 декабря 2005 года состоялась их свадьба. Мало кто знает, что Ходченкова, вступив в брак, взяла фамилию мужа, а девичью оставила как псевдоним. Они не распространялись о причинах краха своего брака, но солгасно источникам, близким к паре, Владимир ревновал Светлану к ее успеху и коллегам мужского пола, в то же время сам был не прочь приударить за симпатичными актрисами.В 2011 году Светлана начала встречаться с бизнесменом Георгием Петришиным. 28 июня 2015 года мужчина сделал любимой предложение: после спектакле «История любви. Книга ошибок», в котором была занята Светлана, он вышел на сцену, преклонил колено и предложил стать его женой, на что Ходченкова ответила согласием. Но свадьба не состоялась. За полгода до намеченного торжества влюбленные расстались. После этого Светлане приписывали отношения с врачом Кириллом Маслиевым, а затем с неким олигархом… В ноябре 2017 года Ходченкова сообщила журналистам, что уже давно состоит в отношениях, основанных на взаимной любви, но более подробной информации не последовало.